持家基因(house-keeping genes)，又称管家基因，是指所有细胞中均要稳定表达的一类基因，其产物是对维持细胞基本生命活动所必需的。如微管蛋白基因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。管家基因是一类始终保持着低水平的甲基化并且一直处于活性转录状态的基因。
管家基因表达水平受环境因素影响较小，而且是在个体各个生长阶段的大多数，或几乎全部组织中持续表达，或变化很小，因此常存在于生物细胞核的常染色质中。它的表达只受启动序列或启动子与RNA聚合酶相互作用的影响，而不受其他机制调节。
管家基因高度保守并且在大多数情况下持续表达，因此管家基因常被用于分子技术，多位点基因分析。一般来说多位点基因分析通常需7个管家基因位点（金黄色葡萄球菌），某些时候可能到10个基因位点（致伤弧菌）。
由于管家基因是生命活动必需的基因，表达相对稳定，差异小。所以在基因芯片技术中根据各芯片的管家基因可以得出标准化系数进行标准化较正；管家基因在所有的细胞中都有表达，因此有关管家基因的概念有助于分析差异表达基因的表达情况，进而进行差异表达基因的克隆。
通过管家基因，能比较不同样本中某种mRNA的水平。在进行基因分离时，可通过不同组织间基因的比较，扣除相同部分后得到差异表达基因，从而得到不同组织间基因表达。
管家基因的表达形式属于组成性表达，管家基因表达的特点是：
1、受环境影响较小。
2、阶段特异性不明显。
