论者认为开凿龙游石窟的主要目的是为了采石。但异议来了：“若要采石，为何不露天开采，而要进行地下开采？”再说从顶部开小口，然后竖式向下开采，增加了无端的麻烦和难度。为什么不把口开大一些？为什么要采用工艺技术要比平洞开挖法和底挖法复杂得多而难度极大的顶挖法呢？
凤凰山24个石窟，左右相邻而不相通，上下相依而不相连，在地下达到如此相对独立又十分近似，绝非偶然。于是，采石说又派生出采石非惟一目的说。论者认为，开凿龙游石窟主要目的是为了采石，但获得的空间另有他用，而这在龙游石窟骗局中曾详细提到过。
论者认为龙游石窟或许是古代吴越帝王或其他诸侯生前建造的陵墓。因为根据石窟顶部呈穹形来推测，很符合汉代以前一些地下王陵的特征。但不可解释的是，既是王陵，理应有陵寝、棺椁及陪葬物，诸如金器、银器、铜器、陶器、瓷器、玉器及珠宝、纺织品或者它们的碎片，但石窟内却空空如也。
这是浙江大学的褚良才博士提出来的。论者认为，从地理角度看，龙游石窟地处衢江、灵山江、塔石溪三水交汇处，在过去以水运为主要交通手段的时代，这儿是交通要津，因而商贾云集、运输繁忙，在江边开凿众多地下石窟用于贮存物资，也在情理之中。然而仓库说不能解释的是，古代龙游经济再发达，也不需要这么多地下仓库来贮存货物。洞厅这么高大，贮存的利用率极低，与常理实情相悖。
外星人造说
龙游石窟是外星人所为，并写了一本书，名为《中国发现外星人疑迹──龙游谜窟》，多方论证龙游石窟为名副其实的巨石文化。但这仅仅是大胆的想象而已，是不现实的。龙游石窟理应是地球上人类创造的奇迹。
龙游石窟留给人们古朴辉煌的同时更多的深不可测的神秘，它可以与埃及金字塔遥相呼应，可以与UFO之谜相提并论，值得广大有识之士去考证探索，去解开这个就在我们身边的世界之谜。但是，探秘志小编认为，龙游石窟是世界上浩大的工程，也是我们的旅游资源，我们有时候没必要一味地去挖掘后面的东西，有些东西挖掘出来并不是好事。也许一切顺其自然会更好！也许有人会去挖掘，但是估计这个千古之谜和世界之谜是无人揭晓答案的！
